La OCDE está gobernada por un Consejo compuesto por representantes de todos los países miembros. El Consejo nombra al Secretario General por un período de cinco años.
La Organización se financia principalmente mediante las cuotas y contribuciones voluntarias de sus países miembros, en el marco del Programa de Trabajo y Presupuesto bienal.
A través del presupuesto, el Consejo autoriza los compromisos presupuestarios y efectúa las consignaciones necesarias para el funcionamiento de la Organización y la consecución de los resultados acordados. Determina la cuantía de las cuotas que deben pagar los miembros teniendo en cuenta otros recursos de la Organización. Todos los países miembros de la OCDE financian el presupuesto de la Parte I. Su escala de contribuciones se basa tanto en una proporción que se reparte equitativamente como en una escala proporcional al tamaño relativo de sus economías.
Los programas de la Parte II se financian con arreglo a una escala de contribuciones u otros acuerdos entre los países participantes. En algunos programas, un número significativo de países no miembros, además de los miembros, contribuyen a los presupuestos de la Parte II. Las otras partidas presupuestarias principales son las pensiones y las publicaciones.
La aprobación del presupuesto por el Consejo faculta al Secretario General, sin perjuicio de las condiciones especiales que establezca el Consejo, para:
- autorizar y comprometer gastos, y efectuar todos los pagos a cargo de la Organización, para los fines asignados y dentro de los límites de las consignaciones o compromisos presupuestarios autorizados
- recibir los ingresos presupuestados, junto con cualesquiera otros recursos que se deriven del programa de trabajo de la Organización
La OCDE goza de privilegios e inmunidades de carácter diplomático, al igual que sus funcionarios y los representantes de los países miembros. La OCDE está exenta del pago de impuestos relacionados con sus ingresos y gastos operativos.
La Organización elabora los estados financieros anuales de conformidad con las IPSAS.