En complément des règles et directives des Systèmes des Semences de l'OCDE dont l'application est obligatoire dans le cadre de la certification, les représentants des pays participants ont développé des "Lignes directrices" qui apportent des informations et proposent des méthodes pratiques auxquelles les Autorités nationales peuvent se référer pour la mise en oeuvre des Systèmes.